Protein–RNA interactions for Protein: P62743

Ap2s1, AP-2 complex subunit sigma, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap2s1P62743 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap2s1P62743 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ap2s1P62743 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms