Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms