Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Paxbp1P58501 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms