Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ctdsp1P58466 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ctdsp1P58466 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ctdsp1P58466 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ctdsp1P58466 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctdsp1P58466 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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