Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms