Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpa1P57784 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms