Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp25P57080 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp25P57080 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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