Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms