Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Irf5P56477 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Irf5P56477 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Irf5P56477 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Irf5P56477 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Irf5P56477 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irf5P56477 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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