Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms