Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms