Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Sh3bp1P55194 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms