Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Map3k1P53349 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms