Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lbx1P52955 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Lbx1P52955 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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