Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upp1P52624 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms