Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms