Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms