Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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