Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VdrP48281 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VdrP48281 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VdrP48281 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VdrP48281 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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