Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gli1P47806 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gli1P47806 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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