Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt1P46096 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms