Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms