Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnar1P33896 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnar1P33896 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms