Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms