Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprmP28828 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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