Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RxraP28700 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RxraP28700 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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