Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atxn10P28658 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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