Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms