Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms