Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde6aP27664 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms