Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CftrP26361 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CftrP26361 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CftrP26361 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CftrP26361 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CftrP26361 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms