Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChgaP26339 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms