Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnna1P26231 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms