Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6bP23440 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pde6bP23440 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pde6bP23440 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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