Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ggta1P23336 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms