Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tap1P21958 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tap1P21958 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tap1P21958 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tap1P21958 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tap1P21958 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms