Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prim1P20664 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms