Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Fcer1aP20489 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Fcer1aP20489 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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