Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou5f1P20263 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms