Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VimP20152 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VimP20152 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VimP20152 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VimP20152 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms