Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NelfeP19426 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NelfeP19426 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NelfeP19426 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms