Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms