Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SrgnP13609 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SrgnP13609 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SrgnP13609 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms