Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RaraP11416 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RaraP11416 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RaraP11416 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms