Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prf1P10820 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prf1P10820 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms