Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
P10404 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
P10404 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
P10404 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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