Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PolP10400 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PolP10400 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PolP10400 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PolP10400 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PolP10400 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PolP10400 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PolP10400 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PolP10400 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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