Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms