Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ly6c1P0CW02 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms