Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprqP0C5E4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprqP0C5E4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprqP0C5E4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprqP0C5E4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprqP0C5E4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms